комбинация аминокислотных остатков в молекуле фермента, обеспечивающая непосредственное связывание ее с молекулой субстрата и прямое участие в акте катализа. Конформация активного центра фермента такова, что она стехиометрически комплементарна субстрату. Таким образом, существует определенное сродство фермента к определенному субстрату. В этом случае достигается максимальная фиксация субстрата
на активных центрах фермента.
активногоцентра.... Активныйцентр также может формироваться благодаря связи ферментов с ионами металов, витаминами и другими... Химическое строение и форма активногоцентра такова, что с ним способны связывать лишь определённые субстраты... Активныйцентр некоторых ферментов в присутствии субстрата может изменять конфигурацию: для обеспечения... Активныйцентр при этом освобождается и способен снова принимать новые молекулы субстрата.
Заболевания сердечно-сосудистой системы – главная причина смертности среди населения по всему миру. Разработка новых препаратов, позволяющих нормализовать артериальное давление, является перспективным направлением в области фармации и медицины. Сейчас широкое распространение для лечения артериальной гипертензии и хронической сердечной недостаточности нашли ингибиторы ангиотензинпревращающего фермента (АПФ). Главный механизм ингибиторов АПФ заключается в блокировании превращения ангиотензина I в ангиотензин II, что опосредует расширение сосудов.Целью данной работы является подбор методики моделирования взаимодействия лизиноприла с активным центром ангиотензинпревращающего фермента с использованием метода молекулярной динамики.Материалы и методы. В качестве лиганда была использована молекула лизиноприла, заряды атомов которой были рассчитаны методом теории функционала плотности (ТФП) ub3lyp с базисными наборами 6-31G* и 6-311G**. Моделирование 75 нс молекулярной динамики взаимодействи...
Фермент взаимодействует с субстратом, но не всей молекулой, а ее отдельным активнымцентром.... Две аминокислоты взаимодействуют между собой в активномцентрефермента, между ними образуется пептидная... Новое вещество (дипептид) покидает активныйцентрфермента, поскольку оно по своей структуре не соответствует... этому центру.... На активностьфермента влияет несколько факторов:
температура.
Обсуждены алгоритмы и программные реализации комбинированного метода квантовой и молекулярной механики в варианте конформационно-подвижных эффективных фрагментов, активно используемого для расчетов энергетических профилей реакций ферментативного катализа
(лат. буквально «в (на) живом»), то есть «внутри живого организма» или «внутри клетки». В науке in vivo обозначает проведение экспериментов на (или внутри) живой ткани при живом организме. Такое использование термина исключает использование части живого организма
(так, как это делается при тестах in vitro) или использование мёртвого организма. Тестирование на животных и клинические испытания являются формами исследования in vivo.
(орган parenchymatosum) – орган, основную массу которого составляет паренхима – совокупность специфических клеток, выполняющих характерную для этого органа функцию, ограниченная соединительнотканной стромой и капсулой (например, эпителий печени, почек, легких и др.).