комбинация аминокислотных остатков в молекуле фермента, обеспечивающая непосредственное связывание ее с молекулой субстрата и прямое участие в акте катализа. Конформация активного центра фермента такова, что она стехиометрически комплементарна субстрату. Таким образом, существует определенное сродство фермента к определенному субстрату. В этом случае достигается максимальная фиксация субстрата
на активных центрах фермента.
активногоцентра.... Активныйцентр также может формироваться благодаря связи ферментов с ионами металов, витаминами и другими... Химическое строение и форма активногоцентра такова, что с ним способны связывать лишь определённые субстраты... Активныйцентр некоторых ферментов в присутствии субстрата может изменять конфигурацию: для обеспечения... Активныйцентр при этом освобождается и способен снова принимать новые молекулы субстрата.
Заболевания сердечно-сосудистой системы – главная причина смертности среди населения по всему миру. Разработка новых препаратов, позволяющих нормализовать артериальное давление, является перспективным направлением в области фармации и медицины. Сейчас широкое распространение для лечения артериальной гипертензии и хронической сердечной недостаточности нашли ингибиторы ангиотензинпревращающего фермента (АПФ). Главный механизм ингибиторов АПФ заключается в блокировании превращения ангиотензина I в ангиотензин II, что опосредует расширение сосудов.Целью данной работы является подбор методики моделирования взаимодействия лизиноприла с активным центром ангиотензинпревращающего фермента с использованием метода молекулярной динамики.Материалы и методы. В качестве лиганда была использована молекула лизиноприла, заряды атомов которой были рассчитаны методом теории функционала плотности (ТФП) ub3lyp с базисными наборами 6-31G* и 6-311G**. Моделирование 75 нс молекулярной динамики взаимодействи...
Фермент взаимодействует с субстратом, но не всей молекулой, а ее отдельным активнымцентром.... Две аминокислоты взаимодействуют между собой в активномцентрефермента, между ними образуется пептидная... Новое вещество (дипептид) покидает активныйцентрфермента, поскольку оно по своей структуре не соответствует... этому центру.... На активностьфермента влияет несколько факторов:
температура.
Обсуждены алгоритмы и программные реализации комбинированного метода квантовой и молекулярной механики в варианте конформационно-подвижных эффективных фрагментов, активно используемого для расчетов энергетических профилей реакций ферментативного катализа
искажение изображений на сетчатой оболочке глаза в результате несовершенства его оптической системы. Оптической системе глаза человека присущи в той или иной степени все виды абберации оптических систем: сферическая, хроматическая, астигматизм.