Биоинформационный анализ генома Morganella morganii subsp. morganii KT позволил идентифицировать в нем гомолог гена гримелизина Serratia grimesii. Ортологи гена гипотетической металлопротеиназы M. morganii обнаружены в геномах разных видов Enterobacteriaceae и представителей других семейств. В промоторной области гена металлопротеиназы M. morganii идентифицированы сайты -10 и -35, а также последовательность Шайна-Дальгарно. С помощью праймеров, сконструированных к гену M. morganii subsp. morganii KT, был амплифицирован ген металлопротеиназы из генома клинического изолята M. morganii ZM. Секвенирование ПЦР-амплификата и BLAST-анализ выявил 83% гомологию нуклеотидных последовательностей генов.
В обзоре представлены данные о регуляции генной активности с помощью рибосвичей (riboswitch). Рибосвичи представляют собой некодирующие элементы мРНК, которые способны связывать низкомолекулярные лиганды и тем самым регулировать транскрипцию, трансляцию, стабильность и альтернативный сплайсинг РНК транскриптов. Контроль экспрессии в данном случае происходит без участия факторов белковой природы. Рибосвичи состоят из двух доменов: высоко-консервативного аптамера, ответственного за связывание лиганда, и экспрессионной платформы, которая регулирует экспрессию гена, изменяя вторичную структуру РНК. У грамотрицательных бактерий изменение вторичной структуры РНК в большинстве случаев приводит к экранированию последовательности Шайн Дальгарно и блокированию инициации трансляции, тогда как у грамположительных бактерий к аттенуации транскрипции. Рибосвичи являются широко распространенным механизмом регуляции генной активности. Данные риборегуляторы обнаружены не только в бактериях и археях, ...