Гель электрофорез в пульсирующем поле (PFGE)

Применение технологии пульс-электрофореза в молекулярном типировании возбудителей особо опасных инфекций

Макрорестрикционный анализ ДНК микроорганизмов с использованием гель-электрофореза в пульсирующем поле (PFGE-типирование, пульс-электрофорез) используется в молекулярной биологии для изучения клональной структуры и типирования возбудителей инфекционных заболеваний. На основании сопоставления паттернов рестрикции ДНК осуществляется установление степени родства, определение эпидемиологических взаимосвязей исследуемых изолятов и изучение эволюционной истории патогенов. В обзоре представлен анализ результатов применения пульс-электрофореза в молекулярно-эпидемиологических исследованиях и изучении филогении возбудителей особо опасных инфекций холеры и чумы. Продемонстрирована возможность характеристики генетической гетерогенности популяций Vibrio cholerae и Yersinia pestis, территориальных и эпидемиологических особенностей распространения изолятов разных пульсотипов, а также обсуждены проблемы и перспективы использования метода PFGE-типирования в системе эпидемиологического надзора за хо...