Кривая «cot»
метод, позволяющий оценивать гетерогенность последовательностей ДНК в препарате.
Библиотека генома
Предмет
Биотехнология
👍 Проверено
Автор24
набор клонированных фрагментов ДНК, содержащий весь геном.
Научные статьи на тему «Библиотека генома»
MPI-программирование
Определение 1
MPI-программирование — это программирование при помощи стандартного набора библиотек...
MPI-программирование
MPI (Message Passing Interface) - это стандартный набор библиотек и интерфейсов...
MPI-программирование может быть использовано для параллельной обработки больших объемов данных, таких как анализ геномов...
различные реализации MPI, такие, как Open MPI, MPICH, Intel MPI и другие, которые предоставляют набор библиотек
Статья от экспертов
Скрининг ВАС-библиотеки лука батуна (Allium fistulosum L. ) на прицентромерный повтор с помощью ДНК-зонда и FISH-анализа
Библиотеки бактериальных искусственных хромосом (Bacterial Artificial Chromosome, BAC) широко используются при анализе геномов и поиска маркеров для идентификации индивидуальных хромосом. BAC клоны в сочетании с флуоресцентной in situ гибридизации (FISH) являются эффективным методом для исследования генома и физического картирования. В работе отражается проведенный ПЦР-анализ 1016 ВАС клонов геномной ДНК Allium fistulosum. В качестве ДНК-зонда для отбора ВАС клонов, несущих прицентромерный повтор, использовали праймеры AfiT32. Данные праймеры были получены авторами ранее при биоинформатическом анализе полностью сиквенированного одного ВАС клона из библиотеки геномной ДНК A. fistulosum. В результате ПЦР-скрининга выявлено три ВАС клона, содержащих данный тандемный повтор. С помощью FISH с отобранными ВАС клонами показана их локализация в прицентромерной области на хромосомах 5 и 6. Полученные цитогенетические маркеры могут быть использованы для интегрирования генетических и физически...
Creative Commons
Научный журнал
Метод исправления ошибок вставки и удаления в наборе чтений нуклеотидной последовательности
Предмет исследования. Разработан метод исправления ошибок вставки и удаления в наборе геномных чтений гаплоидного организма. Приведены результаты тестирования на двух библиотеках искусственно сгенерированном наборе чтений из генома бактерии Escherichia coli и реальной библиотеке чтений бактерии Pseudomonas stutzeri. Метод. Работа метода основана на использовании k -меров. В отличие от большинства распространенных методов исправления ошибок, k -меры используются только для поиска похожих друг на друга чтений. Для похожих чтений вычисляется строка-консенсус, которая затем используется для исправления ошибок в самих чтениях. Основные результаты. Алгоритм реализован в виде самостоятельного программного модуля. Программный модуль протестирован на реальных и синтезированных данных. Качество исправления ошибок разработанного метода выше, чем у известных современных аналогов. Для сравнения использовалась метрика N50, а также суммарная и максимальная длина контига. Практическая значимость. Р...
Creative Commons
Научный журнал
Еще термины по предмету «Биотехнология»
Пироген
вещество, продуцируемое бактериями и вызывающее повышение температуры у человека.
Рост культур
размножение клеток в питательной среде.
- Библеотека генома
- Величина генома
- Библиотека
- Физическая карта генома
- Структурный вариант генома
- Комбинаторная библиотека
- Хромосомная библиотека
- Библиотека генов
- Библиотека кДНК
- Геномная библиотека
- Виртуальная библиотека
- Электронная библиотека
- Библиотека-депозитарий
- Библиотека-филиал
- Детская библиотека
- Муниципальная библиотека
- Научная библиотека
- Национальная библиотека
- Общедоступная библиотека
- Отраслевая библиотека
Повышай знания с онлайн-тренажером от Автор24!
- Напиши термин
- Выбери определение из предложенных или загрузи свое
- Тренажер от Автор24 поможет тебе выучить термины с помощью удобных и приятных карточек
