Цель. Охарактеризовать изменения экспрессии генов популяции Salmonella typhi-murium 14028s с исходной высокой плотностью клеток в условиях голодания по углероду. Материалы и методы. Клетки Salmonella typhimurium 14028s помещали в стерильную безуглеродную минеральную среду с исходным титром 109 КОЕ/мл. Образцы для анализа отбирали через 4 и 72 часа после инокуляции. Из отобранных образцов выделяли суммарную РНК. После удаления ДНК и обогащения матричной РНК, препарат РНК использовали для приготовления библиотек. Приготовление библиотек ДНК проводили с помощью набора Superscript (Illumina, США). Качество полученных библиотек оценивали с помощью генетического анализатора Agilent 2100. Секвенирование проводили на платформе Illumina HiSeq. Данные транскриптомного анализа обрабатывали с помощью программного обеспечения CLC Genomics Workbench. Принадлежность генов тому или иному метаболическому пути определяли по базе данных KEGG. Результаты. Получены данные о более чем 80 дифференциально ...
На основании анализа кристаллической структуры транскрипционного фактора DLX5 человека из исходной библиотеки, содержащей 10 6 химических соединений, методом молекулярного докинга выбраны малые молекулы потенциальные лиганды DLX5. Тестирование 14 соединений in vitro показало, что наилучшей способностью ингибировать пролиферацию лимфомных клеток мыши, экспрессирующих Dlx5, обладает соединение Q12, действие которого сопровождалось снижением экспрессии протоонкогена c-myc. Соединение Q12 проявило низкую токсичность на нормальных клетках эпителия яичника человека и на лимфомных клетках мыши, не экспрессирующих Dlx5. Это соединение может использоваться для дальнейшей химической оптимизации и разработки высокоэффективных противоопухолевых препаратов.